《表1 不同梭菌属序列相似度交叉分析表》

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《浓香型白酒窖泥中梭菌的分离、鉴定及产丁酸性能的比较研究》


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注:Clostridium beijerinckii菌株代表NCBI登录号为NR.029230,Clostridium diolis菌株代表NCBI登录号为NR.025542,Clostridium saccharobutylicum菌株代表NCBI登录号为NR.122061,Clostridium chromiireducens菌株代表NCBI登录号为NR.122090,Clostridium puniceum菌株代表NCBI登

此外,从图1系统发育树可以看出菌株2-1等11个梭菌菌株无法鉴定到种,它们与拜氏梭菌菌群的6个近似属种(拜氏梭菌(C.beijerinckii)、C.diolis、C.saccharobutylicum、C.chromiireducens、C.puniceum、C.saccharoperbutylacetonicum)具有高于97%的相似度。表2为DNAMAN软件对以上6个近似梭菌16S r D-NA序列相似度的交叉分析表。由表1可知:C.beijerinckii与其他近似梭菌C.diolis、C.saccharobutylicum、C.chromiireducens、C.puniceum、C.saccharoperbutylacetonicum的16S r DNA序列相似度分别为97.7%、98.5%、97.9%、97.7%、98.0%,且表1中6种不同梭菌的交叉相似度均超过97%,现有的16S r DNA测序结果和系统发育树分析难以将他们鉴定到种。由于现有的高通量测序技术已经广泛应用于浓香型白酒窖泥、糟醅等样本的研究,其OTU分类是基于16S r DNA序列相似度,即相似度低于97%界定为不同OTU。因此对于16S r DNA序列相似度高于97%的近似属种的高通量数据开展分析时,无疑会低估窖泥梭菌类群的生物多样性。