《表1 引物:流感病毒NS1蛋白与宿主蛋白DOK6的相互作用研究》

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《流感病毒NS1蛋白与宿主蛋白DOK6的相互作用研究》


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根据DOK6参考序列(gene ID:220164)、A/WSN/1933(H1N1)流感病毒NS1蛋白参考序列(LC333189.1)设计引物。提取A549细胞RNA,反转录获得cDNA,以其为模板,采用引物DOK6-F-p CAGGS/DOK6-R-p CAGGS,扩增DOK6基因片段。将p CAGGS-Flag与p CAGGS-V5经KpnⅠ和XhoⅠ双酶切后,与上述扩增的DOK6基因片段同源重组构建p CAGGS-Flag-DOK6与p CAGGS-V5-DOK6真核表达质粒。利用构建的p CAGGS-Flag-DOK6质粒为模板,采用引物DOK6-F-Bi FC/DOK6-R-Bi FC扩增DOK6基因全长片段,采用引物DOK6-F-Bi FC/DOK6-R339-Bi FC PCR扩增DOK6的Pleckstrin同源结构域(Pleckstrin homology domain,PH)(aa1~aa113)基因片段,采用引物DOK6-F391-Bi FC/DOK6-R714-Bi FC PCR扩增DOK6的PTB结构域(aa131~aa238)基因片段,采用引物DOK6-F-Bi FC/DOK6-R714-Bi FC PCR扩增DOK6结构域PH+PTB(aa1~aa238)基因片段,采用引物DOK6-F391-Bi FC/DOK6-R-Bi FC PCR扩增DOK6结构域PTB+C-Terminal(aa131~aa331)基因片段(图1)。将以上扩增片段,与经SacⅠ/XhoⅠ酶切的p CAGGS-VN与p CAGGS-VC载体同源重组,分别构建重组质粒:p CAGGS-DOK6-VN、p CAGGS-DOK6-VC、p CAGGS-PH-VC、p CAGGS-PTB-VC、p CAGGS-(PH+PTB)-VC、p CAGGS-(PTB+C-Ter)-VC。以p HH21-WSN-NS1质粒为模板,采用引物NS1-F-Bi FC/NS1-R-Bi FC PCR扩增NS1全长基因片段,按照上述方法构建重组质粒p CAGGS-NS1-VN、p CAGGS-NS1-VC。所有重组质粒均利用p CAGGS上下游通用引物PCR鉴定,并通过测序进一步鉴定。上述引物具体信息见表1。