《表1 RETN、LEPR和ADIPOQ基因引物序列》
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《RETN、LEPR和ADIPOQ基因多态性与中国汉族人群2型糖尿病风险及血脂代谢的关系》
注:F1、F2、F3为等位基因特异性引物;R为通用反向引物
采用竞争性等位基因特异性PCR(kompetitive allele specific PCR,KASP)技术,自动化设计SNP分型的等位基因特异性引物和通用反向引物,引物序列见表1,由北京一道生物科技有限公司合成。具体实验步骤如下:(1)DNA质检和浓度测定:取1μL置于百泰克ND5000超微紫外可见分光光度计测量,质检合格后的DNA样本方可进行后续的分型实验,质控标准:DNA浓度>20 ng/μL,纯度OD260/OD280=1.6~2.0。(2)DNA均一化处理:质检合格的DNA进行稀释,终浓度是5 ng/μL。(3)PCR反应:取2μL DNA,在55℃45 min烘干,然后配置混合物(mix),3μL体系,需要2×KASP master mix(北京梓熙生物科技有限公司)及引物mix,mix由浓度是100 pmol/μL的F1:F2:R=1:1:2.5的比例混合,引物mix占反应体系的1/72。(4)参比荧光检测:PCR反应体系配好以后,在ABI 7900荧光定量PCR仪上进行预读,然后在ABI 9700 PCR仪再进行PCR反应,94℃5 min,94℃20 s,61℃1 min,共10个循环,降落PCR每次降落0.6℃;94℃20 s,55℃1 min,共26个循环;最后72℃1 min。(5)终荧光检测:PCR完成后,在ABI 7900荧光定量PCR仪上进行后读出,通过SDS2.4进行基因分型和判读。
图表编号 | XD00112547900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.11.25 |
作者 | 郑文文、张杭、周心禾、洪莹、庄飞、吴宸炜、陈霞、何航辉、苏悦、郑超 |
绘制单位 | 温州医科大学附属第二医院育英儿童医院内分泌科、温州医科大学附属第二医院育英儿童医院内分泌科、温州医科大学附属第二医院育英儿童医院内分泌科、温州医科大学附属第二医院育英儿童医院内分泌科、温州医科大学附属第二医院育英儿童医院内分泌科、温州医科大学附属第二医院育英儿童医院内分泌科、温州医科大学附属第二医院育英儿童医院内分泌科、温州医科大学附属第二医院育英儿童医院内分泌科、温州医科大学附属第二医院育英儿童医院内分泌科、温州医科大学附属第二医院育英儿童医院内分泌科 |
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