《表2 本研究所使用的鸟类线粒体基因组信息》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《秧鸡科部分鸟类线粒体基因组的比较及系统发育关系分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

从GenBank上下载表2中的序列后，使用Multiple Sequence Alignment在线软件，进行序列比对。后使用BioEdit v7.0.5（http://www.mbio.ncsu.edu/bioedit/page2.html）软件将比对好的序列进行拆分，拆分为ND1、ND2、COX1、COX2、ATP6、COX3、ND3、ND4L、ND4、ND5、Cytb和ND6等12个蛋白编码单基因，一个非编码序列CR区，12s RNA和16s RNA两个核糖体RNA基因，多个tRNA基因：tRNAPhe、tRNAVal、tRNALeu（UUR）、tRNAIle、t RNAGln、t RNAMet、t RNATrp、t RNAAla、t RNAAsn、t RNACys、tRNATyr、tRNASer（UCN）、tRNAAsp、tR NALys、t RNAGly、t RNAArg、t RNAHis、t RNASer（AGY）、t RNALeu（CUN）、tRNAThr、tRNAPro、tRNAGlu等22个基因。使用DnaS-Pv6软件对上述每一基因及线粒体基因组的变异位点（Variable sites）、简约信息位点（Parsimony informative sites）及变异位点的比例进行分析（Rozas et al.，2017）。