《表1 90K SNP遗传图谱信息》

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《河北省小麦品种基于SNP标记的遗传多样性分析》

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分型结果得到81 587个SNP位点，分布在小麦21条染色体中，质控后24 758个SNP被检测到具有多态性，多态性比率为30.34%（24 758/81 587），其中21 136个SNP被定位于染色体中。根据Wang等（2014）公布的遗传图谱信息，利用21 136个SNP位点构建群体高密度遗传图谱（表1）。每条染色体上分布着51～2 112个SNP位点，差异性较大，其中4D染色体上分布最少（51个），其次为7D染色体（148个），1B和5B染色体上具有多态性的标记较多，分别为2 112个和1 983个。1B染色体上SNP密度最高，平均遗传距离为0.08 cM，4D染色体上密度最低，平均遗传距离为3.16 cM。在小麦3个基因组中，SNP位点分布密度差异性较大，B基因组（10 640个）>A基因组（8 303个）>D基因组（2 193个），平均遗传距离D基因组（0.58 c M）>A基因组（0.15 c M）>B基因组（0.11 cM）。多态性的SNP位点在7个同源群中分布不均匀，其中第1与第2同源群上分布较多，分别为4 077个和3 646个，第4同源群上分布最少（1 750个）。21 136个SNP位点覆盖小麦全基因组3 674.17 cM，平均遗传距离为0.17 cM。因此，在小麦全基因组范围内SNP位点具有较高密度，可以用于揭示小麦品种的遗传多样性。