《表2 样本分组信息:基于SNP推测中国汉族人群身高的遗传学研究》
SD:标准差SD:Standard deviation
使用Plink v 1.90软件对样本基因分型数据进行质量控制,控制条件为:(1)剔除基因分型成功率(call rate)小于90%的样本及SNP位点;(2)剔除MAF<0.01的SNP位点;(3)对人群进行HardyWeinberg平衡检测。经过这一过程后:(1)剔除分型成功率(call rate)小于90%的样本1个;(2)31个SNP位点基因分型成功率大于90%;(3)剔除MAF<0.01的SNP位点4个,该低频位点在本研究人群中未发现多态性,但文献报道中其对身高的显著影响可高达2cm[4];(4)对人群进行HardyWeinberg平衡检测,0个SNP位点(P<10-6)被剔除。质控后剩余样本1220个,剩余SNP位点27个,分组进行关联性分析(表2)。
图表编号 | XD0031081300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.04.20 |
作者 | 支越胜、孙亚男、高行健、刘凡、李彩霞、叶健、赵雯婷、黄艳梅 |
绘制单位 | 新乡医学院法医学院、公安部物证鉴定中心北京市现场物证检验工程技术研究中心现场物证溯源技术国家工程实验室法医遗传学公安部重点实验室、公安部物证鉴定中心北京市现场物证检验工程技术研究中心现场物证溯源技术国家工程实验室法医遗传学公安部重点实验室、济宁医学院法医学与医学检验学院、中国科学院北京基因组研究所、中国科学院北京基因组研究所、公安部物证鉴定中心北京市现场物证检验工程技术研究中心现场物证溯源技术国家工程实验室法医遗传学公安部重点实验室、新乡医学院法医学院、公安部物证鉴定中心北京市现场物证检验工程技术研究中心 |
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