《表2 样本分组信息:基于SNP推测中国汉族人群身高的遗传学研究》

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《基于SNP推测中国汉族人群身高的遗传学研究》


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SD:标准差SD:Standard deviation

使用Plink v 1.90软件对样本基因分型数据进行质量控制,控制条件为:(1)剔除基因分型成功率(call rate)小于90%的样本及SNP位点;(2)剔除MAF<0.01的SNP位点;(3)对人群进行HardyWeinberg平衡检测。经过这一过程后:(1)剔除分型成功率(call rate)小于90%的样本1个;(2)31个SNP位点基因分型成功率大于90%;(3)剔除MAF<0.01的SNP位点4个,该低频位点在本研究人群中未发现多态性,但文献报道中其对身高的显著影响可高达2cm[4];(4)对人群进行HardyWeinberg平衡检测,0个SNP位点(P<10-6)被剔除。质控后剩余样本1220个,剩余SNP位点27个,分组进行关联性分析(表2)。