《表2 遗传图谱详细信息统计》

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《棉花重组自交系铃重性状的QTL定位》

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亲本中棉所36和G2005测序深度分别为6.43×和10.57×，Q30值分别达到89.75%和90.95%；重组自交系群体平均每个株系测序深度约4.59×，Q30值为86.38%。通过与陆地棉参考基因组比对[22]，共得到369 223个SNP，其中亲本间的多态性SNP有78 127个，多态性比例达到21.16%[23-24]。结合多态性SSR（Simple sequence repeat）标记[15]，构建1张包含6 434个位点的高密度遗传图谱（表2），图谱中包含6 295个SNP标记和139个SSR标记，总遗传图距为4 071.98cM，标记间平均距离为0.63 cM，标记间最大距离为18.24 cM，是目前陆地棉种内标记密度最大的图谱之一[25-26]。