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目录1

译者的话1

第1篇　作为信息库的DNA2

第1章　DNA是遗传物质 （杨秀琴　译）2

遗传由大分子实现2

序言 （吴经才　译）3

蛋白质藉构象起作用3

第1版序言 （吴经才　译）4

蛋白质如何获得正确的构象9

DNA的发现11

DNA（几乎）是普遍的遗传物质13

DNA的组成成分15

DNA是双螺旋18

DNA的半保留复制19

补充读物23

第2章　染色体携带基因 （杨秀琴　译）24

基因的发现24

染色体在遗传中的作用28

每个基因都位于一个特定的染色体上31

基因在染色体上呈线性排列32

线性遗传图36

一个基因一种蛋白质37

顺反子的确切定义39

有关术语的注解41

补充读物42

第3章 突变改变DNA序列 （杨秀琴　译）43

遗传密码的三联体译读方式43

点突变改变单个碱基对46

突变集中在热点上47

突变率51

补充读物53

第4章　核酸拓扑学 （杨秀琴　译）54

单链核酸的二级结构54

反向重复和二级结构57

双链体DNA的互变双螺旋结构59

左手螺旋型DNA61

闭合的DNA能形成超螺旋62

超螺旋影响双螺旋结构65

DNA的变性和复性66

碱基配对与核酸杂交67

补充读物68

第5章　分离基因 （董振芳　译）69

限制酶将DNA切成专一性片段70

用DNA片段作限制图72

限制性部位可用作遗传标记75

DNA的序列测定79

原核生物基因和蛋白质的共线性82

真核生物基因的间断性82

某些DNA序列编码一种以上的蛋白质84

模型所涉及的范围86

补充读物87

第2篇 从基因到蛋白质90

第6章　遗传密码的破译 （董振芳　译）90

蛋白质的单向合成91

寻找信使RNA91

转移RNA是转接子（adaptor）92

核糖体结队行进93

大多数密码子代表氨基酸97

密码是否是通用的99

补充读物100

第7章　蛋白质合成的装配线 （董振芳　译）101

核糖体的作用部位101

多肽链的开始103

起始转译需要30S亚基及辅助因子104

30S亚基的短暂游离受IF3控制106

IF2选出起始tRNA107

真核生物转译的起始与多种因子有关108

延伸——T因子将氨酰tRNA带进A部位110

易位移动核糖体112

终止——蛋白质合成的3个终止密码子115

补充读物116

第8章　转移RNA是转译过程的转接子 （董振芳　译）117

通用的三叶草构象117

呈L形的三级结构119

合成酶如何识别tRNA？122

合成氨酰tRNA过程中的识别作用123

密码子-反密码子识别的变偶现象125

tRNA含有许多修饰碱基127

碱基修饰可以控制密码子的识别129

线粒体具有最低数量的tRNA131

突变型tRNA译读不同的密码子131

抑制基因tRNA与正常氨酰tRNA竞争密码子134

tRNA对读码的影响137

补充读物138

第9章　核糖体转译工厂 （董振芳　译）139

核糖体是致密的核糖核蛋白颗粒139

核糖体蛋白与rRNA的相互作用143

摸拟体内装配过程的体外重建实验146

亚基装配涉及拓扑学148

突变可以改变核糖体的所有成分149

核糖体有若干活性中心151

转译的精确性154

补充读物155

第10章　信使RNA模板 （董振芳　译）156

细菌信使的短暂性156

大部分细菌mRNA是多顺反子157

多顺反子信使的转译159

真核生物mRNA功能成分的确定161

体外转译系统的能力162

真核生物mRNA3′末端的多聚腺苷化164

所有真核生物mRNA的5′端都有一个甲基化帽子166

起始作用可能与mRNA和rRNA间的碱基配对有关167

真核生物核糖体小亚基可移动到mRNA的起始部位170

蛋白质合成与细胞定位的关系171

补充读物175

第3篇　制造模板178

第11章　RNA聚合酶——基本的转录装置 （吴经才　译）178

RNA聚合酶对转录的催化作用178

σ因子对RNA聚合酶与DNA结合的控制180

合成RNA的核心酶183

真核生物复杂的RNA聚合酶186

补充读物187

第12章　启动区——控制起始的部位 （吴经才　译）188

大肠杆菌RNA聚合酶的结合部位190

大肠杆菌启动区的共有序列192

共有序列的功能194

σ因子的置换可以控制起始作用196

RNA聚合酶Ⅱ的启动区在起始点上游201

多位分布的RNA聚合酶Ⅱ的启动区204

增强区是有助于起始作用的双向元件206

RNA聚合酶Ⅲ的下游启动区208

补充读物210

第13章　终止作用和抗终止作用 （吴经才　译）211

大肠杆菌中涉及回文对称的两种终止方式212

p因子如何起作用？213

依赖特异性部位的抗终止作用215

RNA聚合酶是否需要更多的亚基？220

真核生物中的难题221

补充读物222

第4篇 原核生物基因表达的控制226

第14章　操纵子——乳糖模型 （吴经才　译）226

诱导和阻遏受小分子物质的控制226

调节基因控制着结构基因227

操纵子的控制回路229

组成型突变解释了阻遏物的作用230

顺式显性的操纵区231

启动区或阻遏物的非诱导型突变233

阻遏物如何阻止转录233

操纵区中的接触部位234

阻遏物亚基的相互作用236

作为DNA结合蛋白的阻遏物237

阻遏物从DNA上的脱落238

剩余阻遏物的储存240

诱导作用的矛盾统一241

补充读物242

第15章 控制回路——操纵子的防卫设施 （吴经才　译）243

正控制和负控制的区别243

色氨酸操纵子的可阻遏性245

色氨酸操纵子受衰减作用的控制247

互变的二级结构控制着衰减作用247

衰减作用的普遍性253

阻遏作用可以发生在多个基因座位上255

分解代谢物阻遏涉及启动区的正调节256

核糖体蛋白转译的自体控制258

自体控制和大分子的装配261

不利环境引起严紧型反应262

补充读物263

第16章　溶菌级联和溶源阻遏 （吴经才　译）265

受级联控制的溶菌发育265

噬菌体T7和T4的功能基因簇267

λ的溶菌级联依靠抗终止作用270

自体调节回路维持溶源性271

在每一操纵区上阻遏物是协同结合的二聚体274

阻遏物的合成是怎样建立的280

溶菌侵染需要抗阻遏物282

溶源和溶菌的微妙平衡284

补充读物285

第5篇 真核生物基因组的组成288

第17章 DNA工程学的卓越力量 （林锦湖　译）288

任何DNA序列都能在细菌里克隆288

嵌合DNA的构建290

由mRNA拷贝出DNA293

从基因组分离特定的基因294

染色体步查296

真核生物基因能在细菌中转译298

补充读物299

描述基因组大小变化的C值矛盾300

第18章　真核生物基因组——序列的连续统一体 （林锦湖　译）300

依赖序列复杂度的复性动力学302

真核生物基因组含有的几种序列组分304

非重复DNA的复杂度可以估算基因组大小305

真核生物基因组含有重复序列306

中度重复DNA由许多不同序列组成307

重复序列家族的成员彼此相关但并不相同308

补充读物310

第19章 体现在mRNA中的结构基因 （林锦湖　译）311

大多数结构基因位于非重复DNA中312

非重复基因得到表达的量313

用RNA驱动反应动力学参数估计基因数目314

基因表达的水平差异极大316

mRNA群体之间的重叠317

补充读物319

第20章 间断基因的组构 （林锦湖　译）320

间断基因的电镜观察321

间断基因的限制图谱324

基因组DNA片段的鉴定327

形式和大小不一的基因328

编码rRNA和tRNA的基因的内含子330

外显子-内含子接界存在共有序列331

一基因的内含子可以是另一基因的外显子332

突变大多定位于外显子内335

复合座位极大且参与调控338

间断基因如何进化？342

补充读物346

第6篇　相关序列成簇排列348

第21章　结构基因属于基因家族 （静天玉　译）348

珠蛋白基因构成两个基因簇349

基因簇因不等交换而重排351

许多α地中海贫血症是不等交换的结果352

β地中海贫血症产生的新基因353

基因簇不断重新组构355

以序列趋异度区别DNA中的两种部位356

用进化钟追踪珠蛋白基因的发展358

维持活性序列的机制360

假基因是进化的死胡同361

大量存在的蛋白质常由基因家族编码362

补充读物364

第22章　细胞器基因组 （静天玉　译）365

细胞器基因表现非孟德尔遗传365

细胞器基因组是环状DNA分子366

细胞器自身基因的表达367

酵母线粒体大基因组370

哺乳动物紧凑的线粒体基因组371

（某些）细胞器DNA的重组373

酵母线粒体DNA的重排374

补充读物375

第23章 串联基因簇的同源性和突变 （静天玉　译）376

为组蛋白编码的各种串联基因簇377

rRNA和tRNA基因是重复基因379

一个串联重复单位包含两种rRNA基因380

某些rRNA基因是染色体外基因382

关于非转录间隔和启动区383

5S基因和假基因是分散基因384

进化的困境385

细菌rRNA基因与tRNA基因形成混合操纵子386

tRNA基因可以成簇存在387

补充读物388

第24章　简单序列DNA的组构 （静天玉　译）389

卫星DNA属于高度重复DNA389

卫星DNA经常位于异染色质上390

节肢动物卫星DNA有极短的同源重复391

哺乳动物卫星DNA由不同层次的重复单位组成392

小鼠卫星DNA进化阶段的再现395

现有重复单位的突变398

不等交换的结果398

交换固定是维持同源重复的原因400

补充读物401

第7篇　RNA的加工成熟404

第25章　稳定RNA的切割和修整 （王立　译）404

磷酸二酯键的两种酶切方式405

RNA酶Ⅲ释放噬菌体T7的早期mRNA405

RNA酶Ⅲ从rRNA前体切下rRNA408

真核生物前体RNA释放rRNA时的切割部位409

几种酶对tRNA的切割和修整410

补充读物412

第26章　RNA是催化剂——RNA的剪接机制 （王立　译）414

酵母tRNA剪接过程的切割与重新连接414

四膜虫rRNA的异常剪接418

RNA是催化剂——生物化学催化作用的扩充420

可以编码调节蛋白的内含子421

核RNA按最佳途径进行剪接426

共有序列的突变影响剪接428

细胞核RNA的剪接接界可以互换430

snRNA是否与剪接有关？432

补充读物436

大而不稳定的hnRNA438

第27章　RNA加工的控制 （董振芳　译）438

mRNA来自hnRNA440

多聚腺苷酸化及3′末端的产生442

比mRNA更复杂的hnRNA444

转录后还存在控制吗？445

控制基因表达的模型446

细胞多蛋白的潜力449

补充读物451

第8篇　DNA的包装454

第28章　基因组和染色体 （静天玉　译）454

病毒基因组于衣壳中的凝缩455

细菌基因组是具有许多超螺旋回环的核质体459

分裂间期染色质和有丝分裂染色体的比较461

真核生物染色体是有丝分裂的分离装置464

灯刷染色体的伸展状态468

多线巨大染色体470

转录使染色体结构松散471

补充读物473

第29章　染色质结构——核小体 （静天玉　译）474

染色质的蛋白质组分474

染色质含有非连续性颗粒476

核小体是一切染色质的亚单位477

极其保守的核心颗粒479

DNA盘绕在组蛋白八聚体的周围481

核酸酶对DNA的作用是对称的483

有关DNA结构周期的悬而未决的问题485

组蛋白和DNA的排列486

核小体是否呈定相排列488

核小体在染色质纤维中的排列方式492

回环、结构域和骨架494

补充读物495

第30章　活性染色质的特性 （静天玉　译）496

核小体的装配与染色质的再生496

核小体的装配需要非组蛋白500

被转录的基因是否在核小体中组构？501

对DNA酶敏感的可转录染色质的结构域504

非组蛋白造成染色质对DNA酶的敏感性506

组蛋白的瞬间修饰508

在核小体的一个亚单位上H2A与泛素的结合510

基因表达与脱甲基化的关系511

控制甲基化的一些模型513

DNA酶超敏部位位于活化启动区的上游514

核小体无超敏部位517

有关基因活化性质的推测520

补充读物521

第9篇 永恒的DNA524

第31章 复制子——DNA复制单位 （静天玉　译）524

连续复制形成复制眼525

细菌基因组是一个复制子527

复制与细胞周期的联系528

真核生物染色体含多个复制子530

分离酵母复制子的起点532

复制眼、滚环或D环是实现复制的几种形式533

质粒不相容性与拷贝数的关系537

补充读物540

第32章　DNA的复制装置 （静天玉　译）541

真核生物的DNA聚合酶542

原核生物的DNA聚合酶有多种酶学活性542

DNA的半间断合成546

曲RNA引发冈崎片段的合成548

细菌复制装置的复杂性551

单链DNA的起始合成552

引物体的移动554

在双链体起点上起始复制557

T4噬菌体的复制装置561

T7噬菌体的复制装置563

线性复制子所存在的问题563

补充读物566

第33章　DNA的防卫系统 （静天玉　译）567

限制及修饰作用的运用568

Ⅰ型酶的其他活性570

Ⅲ型酶的双重活性573

对损伤DNA的处理574

大肠杆菌的切补系统577

大肠杆菌的重组修复系统579

许多基因的SOS反应系统580

哺乳动物的修复系统582

补充读物583

第34章　DNA重组和其他拓扑学变换 （静天玉　译）584

DNA的拓扑学变换584

促旋酶使DNA产生负超螺旋588

重组作用要求同源双链体DNA发生联会589

断裂和复合与异源双链体DNA有关590

双链DNA的断裂能起始重组作用吗？593

重组中间体的分离595

RecA的链交换装置596

RecA和重组条件598

基因转换是等位基因重组的原因600

特殊重组识别特异性序列602

核心的交错断裂与复合603

补充读物606

第10篇 动态基因组：状态变化不定的DNA608

第35章　细菌的转座因子 （蒋如璋　译）608

细菌中转座作用的发现609

插入序列是基本的转座子610

复合转座子具有IS组件611

只有一个Tn10的组件是有功能的614

序列几乎同源而功能相差很大的Tn5组件615

转座与复制重组有关616

通过共合体解离实现Tn3转座619

转座噬菌体Mu的一些特殊性质621

倒位引起沙门氏杆菌的相变623

补充读物625

第36章　真核生物的可移动遗传因子 （蒋如璋译）626

与细菌的转座子相似的酵母Ty因子627

果蝇中的几类转座因子628

转座因子在杂种不育过程中的作用630

转座是逆病毒生活史的一部分632

逆病毒可以转导细胞DNA635

在细胞中可能发生依赖于RNA的转座过程636

Alu家族637

玉米控制因子是可转座的638

Ds因子可以转座或引起染色体断裂640

Ds转座与DNA复制衔接642

酵母具有缄默和活性接合型座位643

有相同序列的缄默盒和活性盒645

通过受体MAT座位起始的单方向转录648

补充读物649

第37章　重组体与免疫多样性的产生 （蒋如璋　译）651

免疫球蛋白的组构651

由多部分装配起来的免疫球蛋白基因654

种质细胞系信息的多样性656

连接反应产生更大的多样性658

V基因和C基因重组产生的缺失和重排659

等位基因排斥的一些可能的原因661

DNA进一步重组导致类型变换662

染色体重排使免疫球蛋白基因活化664

RNA加工可以改变早期重链的表达665

体细胞突变进一步产生多样性667

T细胞受体与免疫球蛋白相关668

主要组织相容性座位的复杂性669

补充读物671

第38章　用基因工程技术改变基因组 （蒋如璋　译）672

果蝇基因组的组织特异性变异672

基因组扩增序列的选择675

外源DNA序列可以通过转染引入受体细胞678

转染DNA可以进入种质细胞系680

补充读物683

名词解释 （静天玉　译）684

补遗703

《基因》第3版跋 （劳为德　译）703

分子水平上发育研究的趋势 （劳为德）705