《畜禽育种中的线性模型》求取 ⇩

目录1

第一章 线性代数预备知识1

1.1 纯量,矩阵与向量1

1.2 一些特殊的矩阵1

1.3 矩阵的运算3

1.4 二次型5

1.5 矩阵的导数6

1.6 方差协方差矩阵8

1.7 特征值与特征向量10

1.8 Kronecker乘积11

1.9 矩阵向量化11

1.10 广义逆矩阵12

2.1 线性模型的概念15

第二章 线性模型基础15

2.2 线性模型的矩阵表达式17

2.3 虚变量模型17

2.4 线性模型举例19

2.5 线性模型分类20

2.5.1 按试验因子个数分类20

2.5.2 按效应性质分类22

2.6 环境效应与遗传效应24

2.6.1 环境效应24

2.6.2 遗传效应25

2.7 数据资料的结构25

第三章 参数的最小二乘估计28

3.1 常规最小二乘估计28

3.1.1 最小二乘方程组28

3.1.2.1 系数矩阵(X′X)满秩时的求解29

3.1.2 最小二乘方程组的求解29

3.1.2.2 系数矩阵(X′X)非满秩时的求解30

3.1.3 最小二乘估计量的标准误与相关系数44

3.2 广义最小二乘估计46

3.2.1 广义最小二乘方程组46

3.2.2 广义最小二乘估计量的性质49

3.2.3 广义最小二乘估计举例49

第四章 育种值估计方法52

4.1 育种值的概念52

4.2 选择指数52

4.2.1 单个性状的育种值估计52

4.2.2 多性状的育种值估计57

4.3 最佳线性无偏预测58

4.3.1 BLUP法的基本理论58

4.3.2 混合模型方程组62

4.3.3 BLUP估计值的性质66

4.3.4 BLUP应用举例68

第五章 畜禽遗传评定模型72

5.1 公畜模型72

5.2 公畜—母畜模型73

5.3 外祖父模型74

5.4 个体动物模型76

5.5 简化动物模型77

5.6 各种模型的比较82

5.7 等价模型83

5.8 其它模型84

第六章 BLUP法的有关计算技术87

6.1 分子血缘相关矩阵A及其逆矩阵A-1的计算87

6.1.1 A的计算方法87

6.1.2 A-1的计算方法89

6.2 吸收法93

6.3 混合模型方程组的迭代求解97

6.3.1 经典的迭代方法98

6.3.2 间接解法99

6.3.3 向动物模型的推广101

第七章 多性状的BLUP方法103

7.1 概述103

7.2 HENDERSON的近似方法106

7.3 数据转换112

7.4 关于BLUP法的结语113

第八章 方差组分估计方法—Ⅰ115

8.1 一般基础知识115

8.1.1 数量遗传学基础115

8.1.2 统计学基础116

8.2.1 利用半同胞记录估计方差组分117

8.1.3 二次型的一些基本性质117

8.2 随机模型下的方差组分估计117

8.2.2 利用全同胞—半同胞记录通过ANOVA估计方差组分127

8.2.3 由亲子比较估计方差参数130

8.2.4 由选择试验估计实现遗传相关132

8.3 方差组分估计新方法概述133

8.3.1 用任意二次型进行方差组分的无偏估计133

8.3.2 用约化平方和估计方差组分135

8.4 方差组分估计步骤及估计值的性质143

8.4.1 方差组分估计的一般步骤143

8.4.2 方差组分估值的性质143

第九章 方差组分估计方法—Ⅱ146

9.1 HENDERSON方法Ⅰ146

9.1.1 基本方法146

9.1.2 举例148

9.2 HENDERSON方法Ⅱ151

9.2.1 基本方法151

9.2.2 理论推导151

9.2.3 举例154

9.3 HENDERSON方法Ⅲ157

9.3.1 基本方法157

9.3.2 举例159

9.4 HENDERSON方法Ⅳ及其他类似的方法161

9.5 MINQUE和MIVQUE163

9.5.1 MINQUE估计方程的理论推导164

9.5.2 通过混合模型方程组求MINQUE166

9.5.3 举例171

9.6 ML法和REML法172

9.6.1 最大似然法的一般原理172

9.6.2 ML法175

9.6.3 REML法180

9.6.4 举例183

9.6.5 加快迭代收敛速度的方法—CIA185

9.7 MINQUE、ML和REML的比较187

第十章 协方差组分估计189

10.1 两个随机效应间的协方差189

10.1.1 MINQUE190

10.1.2 REML190

10.2 性状间的协方差190

10.2.1 第一种情形191

10.2.2 第二种情形193

10.2.3 第三种情形194

10.3 关于方差和协方差组分估计的结语199

参考文献201

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