《表3 5对核心引物信息:葛根SSR特征及江西粉葛DNA身份证的构建》

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《葛根SSR特征及江西粉葛DNA身份证的构建》


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使用BioEdit软件对野葛和甘葛藤基因组中含有SSR的序列做同源比对,通过野葛和甘葛藤基因组中含有SSR的同源序列的比对,共获得40 146对同源序列对,从中筛选出20对差异SSR,继而设计了20对SSR引物。从每个栽培种中随机挑选1个个体,使用设计的20对SSR引物进行PCR扩增,产物经2%琼脂糖凝胶电泳检测,选择扩增条带清晰、产物大小与预期大小相符的引物进行进一步研究。从中筛选出了12对引物,其PCR扩增产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,筛选出了5对多态性较强、扩增带型稳定、重复性较好的引物(表3)。用这5对核心引物进行江西产区9个粉葛种DNA身份证的构建,共检测到32个等位基因,扩增出的片段大小在100~400 bp。