《表2 3个香稻品种InDel检测及注释结果统计》

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《基于基因组测序揭示香稻Badh2基因的变异信息》


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利用SAMTOOLS对XW13、YZX及XW17进行SNP和In Del检测,各品种检测到的SNP数目介于1 706 194~1 868 460之间,In Del数目介于296 674~318 410之间。利用ANNOVAR对检测结果进行注释,得到各品种SNP和In Del注释结果信息,见表1和表2。各品种SNP和In Del在基因组上的分布频率见图1和图2(以XW13为例)。