《表5 基于Mi CA比对分析优势T-RFs片段代表的菌群》

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《异育银鲫养殖环境典型病原微生物检测和细菌群落解析》


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注:-:Mi CA在线比对不能确定的种属.

为了解析细菌T-RFLP图谱中不同T-RF片段代表的微生物类群,基于MiCA(http://mica.ibest.uidaho.edu/pat.php)T-RFLP analysis(PAT+)在线分析,通过RDA 16S r RNA基因数据库查询比对结果,推测相应的T-RFs片段所代表的种属菌群。如表5所示,优势T-RFs片段所代表的菌群主要归属于Proteobacteria、Firmicutes、Bacteroidetes、Actinobacteria和Chloroflexi。