《表2 地熊蜂beta-arrestin基因氨基酸序列分析表》

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《地熊蜂非视觉相关beta-arrestin基因的克隆与表达谱分析》

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通过NCBI数据库对该基因结构分析表明，地熊蜂beta-arrestin基因含有8个外显子，7个内含子，本研究的beta-arrestin基因mRNA全长5 819bp，利用PCR成功克隆了beta-arrestin基因编码序列，其CDS长1 248bp（图2）；CDS编码一个415aa的蛋白，分子量大小45.98kD，等电点为6.51，为酸性氨基酸（表2）。ExPASy ProtParam在线分析表明，beta-arrestin蛋白分子式为C2053H3281N555O618S11。在组成beta-arrestin蛋白的20种氨基酸中，亮氨酸（Leu）所占比例最高，达9.9%；蛋氨酸（Met）所占比例最低，为1.0%；带正、负电荷的氨基酸总数分别为56和60。总平均亲水性系数、脂溶指数、不稳定系数分别为0.359、89.49、39.55，表明beta-arrestin是一种稳定的脂溶性蛋白。该蛋白氨基酸序列中第27～182个氨基酸残基为Arrestin-N superfamily的保守结构域（E值:1.53e-41）；第201～354个氨基酸残基为Arrestin-C superfamily的保守结构域（E值:1.07e-35）。二级结构预测结果显示，betaarrestin编码的蛋白以卷曲环（coil loop）为主，占50.84%，β-折叠（strand）和α-螺旋（helix）所占比例分别为:44.34%和4.82%。beta-arrestin基因编码的氨基酸序列和NCBI中收录的地熊蜂转录组数据的氨基酸序列进行比对，结果表明克隆的地熊蜂beta-arrestin基因编码的氨基酸序列与NCBI中收录的地熊蜂转录组数据的氨基酸序列一致性高达97%，经分析缺失的2个氨基酸不在该基因外显子边界附近，因此这可能是不同基因座上的拷贝，也可能是个体之间单核苷酸多态性导致（图3）。