《表1 DOE方案:实验设计在原核表达条件优化中的应用》

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《实验设计在原核表达条件优化中的应用》


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使用Minitab17中的DOE功能创建响应曲面设计,根据影响Ferritin表达的因素进行设定,并生成DOE方案,见表1。通常所用的响应曲面设计方法包括中心组合设计(Central Composite Design,CCD)和Box-Benhnken(BBD)实验,由于CCD的设计过程中有很多点会超出原定的水平,而在实验室条件下所采用的条件范围是有限的,因此研究采用BBD实验设计方法。将活化菌液按1∶50接种于新鲜LB培养基中,置于37℃水平摇床,按照DOE方案生成程序中的运行序进行试验(表1)。选择将标准序打乱为随机序以降低操作带来的系统误差,再按照运行序进行试验。试验结束后,按照上述方法分别收集1 mL培养基样品,经10%SDS-PAGE分析各样品中重组蛋白的表达量,并作为响应值输入Minitab软件进行统计分析。通过绘制等值响应曲面图及拟合回归方程,并使用响应优化器对最优表达条件进行预测,再用等值曲面图对不同方法得出的表达条件进行分析和比较。