《表1 玉米CCCH家族成员的特征》
通过Pfam数据库下载的CCCH基因家族的隐马氏模型(Pfam号码:PF00642),利用SMART和CDD检测蛋白序列结构域,最终获得63个玉米CCCH基因序列,分别命名为ZmCCCH1-ZmCCCH63(表1)。分析玉米63个CCCH蛋白序列发现不同蛋白有所差异:氨基酸长度范围从110 aa(Zm CCCH53)到962 aa(Zm CCCH59),开放阅读框从519 bp(Zm CCCH16)到24 149 bp(Zm CCCH10),分子量范围从12.02 kDa(Zm CCCH53)到107 kDa(Zm CCCH59),等电点范围从4.76(Zm CCCH16)到10.13(Zm CCCH8),基因含1~14个内含子。通过对蛋白的分析,可知CCCH蛋白序列无论是长度还是特性变化都很大,说明该基因家族的蛋白具有不同的特性。部分CCCH蛋白的等电点小于7,说明CCCH可能编码弱酸性的蛋白,在酸性的亚细胞环境中发挥作用,结果与赵艳等[27]研究一致。
图表编号 | XD0071529600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.08.01 |
作者 | 郭栋、宋雅菲、张佳阔、袁慧敏、杜媚、刘颖慧、袁卉馥 |
绘制单位 | 河北北方学院农林科技学院、河北北方学院农林科技学院、河北北方学院农林科技学院、河北北方学院农林科技学院、河北北方学院农林科技学院、河北北方学院农林科技学院、河北北方学院农林科技学院 |
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