《表1 猪ETS家族成员特征信息》
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《猪全基因组范围ETS基因家族成员的鉴定、进化与表达分析》
通过HMMER软件hmmersearch工具,结合BLAST,本研究在猪基因组上共识别24个ETS家族基因,在基因组上分布情况见图1。猪ETS家族每个基因特征信息详见表1。这些ETS基因分布在11条染色体,其中第6、9、13号染色体上均存在4个ETS基因;基因GC含量从35.90%到64.40%。分析蛋白质一级结构发现,ETS基因家族成员氨基酸长度变化范围较大,从237氨基酸(FEV)到629氨基酸(ETV5);等电点变化范围为4.77(ETS2)到9.28(FEV);脂溶性系数为51.26(ETV1)到95.29(GABPA)。总平均亲水性(GRAVY)定义为序列中所有氨基酸亲水值总和与氨基酸总数比值,负值越大表示亲水性越好,正值越大表示疏水性越强,ETS家族成员GRAVY均为负值。
图表编号 | XD00148414500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.05.25 |
作者 | 王志鹏、周萌、郭媛媛、张超鑫、王涛、刘胜伟、闫晓红、丁坤、朱秋思、杨里昂 |
绘制单位 | 东北农业大学动物科学技术学院、东北农业大学生物信息中心、东北农业大学黑龙江省高校动物遗传育种与繁殖重点实验室、东北农业大学动物科学技术学院、东北农业大学生物信息中心、东北农业大学黑龙江省高校动物遗传育种与繁殖重点实验室、东北农业大学动物科学技术学院、东北农业大学生物信息中心、东北农业大学黑龙江省高校动物遗传育种与繁殖重点实验室、东北农业大学动物科学技术学院、东北农业大学生物信息中心、东北农业大学黑龙江省高校动物遗传育种与繁殖重点实验室、东北农业大学动物科学技术学院、东北农业大学生物信息中心、东北农业大学黑 |
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