《表5 相关基因同源比对分析》

《表5 相关基因同源比对分析》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《利用转录组测序分析茄子萼片刺相关差异基因》


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将双亲和2个混池的差异基因通过Go和KEGG分析富集筛选的3个相关基因(Eggplant_newGene_1802、Sme2.5_09750.1_g00002、Eggplant_newGene_4241)和拟南芥、番茄的基因组进行同源Blast比对分析(表5)。和番茄基因组(Tomato Genome CDS (ITAG release 3.20)) 比对,Eggplant_newGene_4241和Sme2.5_09750.1_g00002在番茄的同源基因分别为Solyc11g067180.2和Solyc01g079300.3,它们在番茄中分别负责编码脂肪酰基辅酶A还原酶和水苏糖合成酶的合成,Eggplant_newGene_1802比对到2个同源基因,为Solyc04g080820.2和Solyc04g080810.3,它们在番茄中分别负责编码细胞分裂素氧化酶和细胞分裂素氧化酶/类脱氢酶的合成。和拟南芥基因组比对,Eggplant_newGene_4241未能找到与拟南芥同源基因,Eggplant_newGene_1802在拟南芥的同源基因为AT1G75450.1(At CKX6),它编码催化类细胞分裂素降解的酶(细胞分裂素氧化酶/脱氢酶),Sme2.5_09750.1_g00002在拟南芥的同源基因为AT4G01970.1(AtRS4),它编码棉子糖和高亲和力的水苏糖合成酶以及水苏糖和Gol特异性半乳糖水解酶(Sta和Gol特异性半乳糖水解酶)。