《表5 菌丝体、原基中差异表达基因的同源比对结果》
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《秀珍菇不同生长阶段在低温刺激后的转录组及差异基因表达分析》
1~8为S3中显著上调基因,9~16为S3中显著下调基因
为了解菌丝体常温培养与低温诱导后,低温诱导后恢复至常温与原基形成后2组不同生长发育阶段差异表达基因的情况,对具有显著差异表达的基因进行了分析。将经同源比对(Blast-Nr)得到的有确切功能的基因列于表4 (S1对比S0差异表达显著上调、显著下调的各前8个基因)、表5(S3对比S2差异表达显著上调、显著下调的各前8个基因)。从表4中可以看出,秀珍菇经过低温诱导后,表达量上升的基因主要与载体蛋白、锌指蛋白、烷基转移酶活性、天冬氨酸内肽酶活性、氧化还原、跨膜运输等相关;表达量下降的基因主要与转录因子活性、鸟嘌呤-5'-三磷酸(guanosine triphosphate,GTP)酶活性、Rho (Ras homologue)蛋白信号、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(nicotinamide adenine dinucleo‐tide phosphate,NAD(P))氧化还原酶活性、胞内蛋白运输等相关。从表5可知,低温诱导后恢复至常温的菌丝体与原基相比较,原基阶段表达量上升的基因主要与转录调节、细胞壁生物合成、核糖体合成、甲基化、离子通道相关;表达量下降的基因主要与翻译抑制、泛素转移、氧化还原、蛋白糖基化、DNA修复、谷胱甘肽代谢等相关。
图表编号 | XD00224413800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.25 |
作者 | 王伟科、陆娜、闫静、宋吉玲、袁卫东、周祖法 |
绘制单位 | 杭州市农业科学研究院、杭州市农业科学研究院、杭州市农业科学研究院、杭州市农业科学研究院、杭州市农业科学研究院、杭州市农业科学研究院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |