《表2 淮安市褐家鼠携带SEOV的单倍型及遗传多样性》

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《江苏省淮安市啮齿动物感染正汉城病毒的基因特征研究》

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注：#表示检索不到宿主，*表示未做检测。

以SEOV基因亚型作为种群分布分析的依据，对SEOV的种群进行检测，结果显示共获得SEOV的21种单倍型，见表2。其中单倍型Hap3、Hap6、Hap8、Hap11、Hap15和Hap20为共享单倍型，其余单倍型为独享单倍型。SEOV S1基因亚型和S5基因亚型各有2个共享单倍型，S3和S4各有1个共享单倍型。盱眙株（XuyiRn43和XuyiRn68）均为独享型单倍型，分别为Hap1和Hap2。28条S基因序列分析得到SEOV的多态性位点为102个，单倍型多样性（Hd）为0.9790，核苷酸多样性（π）为6.72%，其中盱眙株所属的S1基因亚型的SEOV的多态性位点为13个，SEOV的Hd为0.9110，π为0.85%。