《表1 SSR在芦笋EST数据库中出现的频率》

《表1 SSR在芦笋EST数据库中出现的频率》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于NCBI数据库芦笋EST-SSR标记的开发》


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注:a所占比例:重复基元数目/重复类型总数;b发生频率:重复基元数目/总EST数目类型

从NCBI的EST数据库下载获得了8 615条EST,经过拼接和SSR序列位点查找后,共得到含有EST-SSR位点的序列483条,占总数的5.6%(表1)。其中,467条EST序列含有1个SSR位点,其余的16条含有1个以上的SSR位点序列。在重复数类型中,二核苷酸和三核苷酸所占频率最大,分别为1.8%和2.3%;其次是六核苷酸,为1.3%,说明芦笋EST序列中SSR数量和类型较为丰富。