《表5 目前已获得EST-SSRs出现频率的部分水生动物》
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《基于全长转录组测序的金乌贼微卫星位点筛选与特征分析》
本研究以金乌贼转录组信息对其EST-SSR进行开发。结果显示,金乌贼转录组中含有丰富的SSR位点。从金乌贼转录组的177,951条Unigene中,共搜索出161,327个SSR,分布在64,933条Unigene中,SSR的出现频率为90.66%。与其他水生动物SSR的出现频率相比,明显高于扁玉螺(Neverita didyma)(86.53%)(卢玮筱等,2018)、黄姑鱼(Nibea albiflora)(39.30%)(龚诗琦等,2016)、翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)(27.51%)(袁文成等,2015)、罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)(45.91%)(王传聪等,2018)、无针乌贼(Sepiella japonica)(48.70%)(吕振明等,2017;管奥等,2018)、马氏珠母贝(Pinctada martensii)(13.34%)(王忠良等,2015)、栉江珧(Atrina pectinata)(8.2%)(李东明等,2017)、缢蛏(Sinonovacula constricta)(8.89%)(刘博等,2012)、泥蚶(Tegillarca granosa)(14.83%)(周小龙等,2013)(表5)。
图表编号 | XD00222169000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.01 |
作者 | 张金勇、何暮春、项子龙、柳淑芳、庄志猛 |
绘制单位 | 中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室、青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室、南京农业大学无锡渔业学院、中国海洋大学海洋生命学院、中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室、青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室、上海海洋大学水产与生命学院、中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室、青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室、南京 |
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