《表5 目前已获得EST-SSRs出现频率的部分水生动物》

《表5 目前已获得EST-SSRs出现频率的部分水生动物》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于全长转录组测序的金乌贼微卫星位点筛选与特征分析》


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本研究以金乌贼转录组信息对其EST-SSR进行开发。结果显示,金乌贼转录组中含有丰富的SSR位点。从金乌贼转录组的177,951条Unigene中,共搜索出161,327个SSR,分布在64,933条Unigene中,SSR的出现频率为90.66%。与其他水生动物SSR的出现频率相比,明显高于扁玉螺(Neverita didyma)(86.53%)(卢玮筱等,2018)、黄姑鱼(Nibea albiflora)(39.30%)(龚诗琦等,2016)、翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)(27.51%)(袁文成等,2015)、罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)(45.91%)(王传聪等,2018)、无针乌贼(Sepiella japonica)(48.70%)(吕振明等,2017;管奥等,2018)、马氏珠母贝(Pinctada martensii)(13.34%)(王忠良等,2015)、栉江珧(Atrina pectinata)(8.2%)(李东明等,2017)、缢蛏(Sinonovacula constricta)(8.89%)(刘博等,2012)、泥蚶(Tegillarca granosa)(14.83%)(周小龙等,2013)(表5)。