《表3 芦笋EST中SSR重复长度和性质》

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《基于NCBI数据库芦笋EST-SSR标记的开发》


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根据SSR重复基元类型是否存在间断,可将芦笋的SSR类型分为429个完全重复基元和54个不完全重复基元EST-SSR,所占已有EST-SSR序列的88.8%和11.2%,表明完全重复基元类型占绝对优势(表3)。在已收集的芦笋EST序列中,其SSR的平均长度为25.63 bp,并且不同的SSR其长度范围变化差异幅度大,最短的为18 bp,最长的为84 bp。其中,二核苷酸变化范围最大,在20~84 bp之间,而五核苷酸变化范围最小,在20~25 bp之间。