《表1 大豆NBS-LRR抗病基因在染色体上的分布数量》

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《豆科抗病基因NBS-LRR进化的多基因组比对分析》

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注:0a:基因没有定位到染色体上

分析发现，豆科基因组中抗病基因不均匀的分布在染色体上，并在一些染色体上存在由串联重复产生的重复基因。如将鉴定的大豆819个NBS-LRR抗病基因根据基因在染色体上位置，得到基因在染色体上的分布情况（表1），大豆不同染色体上NBS-LRR抗病基因数量不同。其中较多的是分布在3号、16号和17号染色体上，分别约占所有抗病基因的8.2%（67），7.7%（63）和9.4%（77）；4号染色体上NBS-LRR抗病基因最少，仅含有1.2%（10）；分布在60个以上NBS-LRR抗病基因的染色体有4条（分别是3号，13号，16号和18号染色体），拷贝数低于30的有4条染色体（分别是4号，5号，10号和17号染色体）。大豆基因组中有20个抗病基因分布集中的区域，每个区域抗病基因间的物理距离小于2 Mbp，基因序列之间的Ks<0.15，推断这些基因是由于串联重复产生，且基因之间的复制是发生在大豆特异性加倍之后的很近的时间里（Wang et al.，2017），其中一个较大的区域在19号染色体上，包含了11个基因（Gm19g-31528，Gm19g31536，Gm19g31544，Gm19g31651，Gm-19g31662，Gm19g31674，Gm19g31686，Gm19g31698，Gm19g31843，Gm19g31856和Gm19g31881），11个基因之间的平均物理距离为0.031 Mbp，平均Ks=0.117，最小的Ks=0.027，数据结果表明这一区域是串联重复的热点区域，并且可能在持续发生；类似串联重复在3号、16号和18号染色体上也有发现，这可能是导致这几条染色体抗病基因数目明显多于其他染色体的原因。