《表3 候选蛋白编码基因在染色体上的分布》
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《猪蛋白编码基因3'UTR中IRPRE1元件的鉴定及其基因特征分析》
先去除猪全基因组范围内的22 342个蛋白编码基因3'UTR中不含有SINE/t RNA重复元件的基因,留下5 017个蛋白编码基因;再去除SINE/t RNA重复元件中不含Pre0_SS与PRE1x元件的基因,留下4 486个蛋白编码基因;然后去除Pre0_SS与PRE1x元件全部为同一方向、长度小于100 bp的Pre0_SS和PRE1x的基因,最终得到1 094个候选蛋白编码基因,对应1 636个转录本,进一步分析发现,这1 636个转录本中PRE1家族元件的长度为10~323 bp。如表3所示,1 094个蛋白编码基因在猪不同染色体上的分布不同,其中Y染色体上的最少,只有3个。1~4号和6号染色体上的较多,其中6号染色体的最多,达117个。
图表编号 | XD00160851800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.25 |
作者 | 赵为民、曹静、邢菲、王丽、任守文、付言峰、李碧侠、方晓敏 |
绘制单位 | 江苏省农业科学院畜牧研究所、江苏省农业种质资源保护与利用平台、江苏省农业科学院动物品种改良和繁育重点实验室、江苏农科传媒有限公司、南京农业大学动物科技学院、江苏省农业科学院畜牧研究所、江苏省农业种质资源保护与利用平台、江苏省农业科学院动物品种改良和繁育重点实验室、江苏省农业科学院畜牧研究所、江苏省农业种质资源保护与利用平台、江苏省农业科学院动物品种改良和繁育重点实验室、江苏省农业科学院畜牧研究所、江苏省农业种质资源保护与利用平台、江苏省农业科学院动物品种改良和繁育重点实验室、江苏省农业科学院畜牧研究所、江 |
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