《表2 海参样品基于COI和16S rRNA基因的物种鉴定结果》

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《基于DNA条形码技术的海参物种鉴定》

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注:“/”指COI序列在BOLD数据库无匹配。目前已将本研究获得的BOLD数据库缺少的海参COI序列信息上传至BOLD数据库。

目前用于物种鉴定的16S rRNA基因数据库只有GenBank数据库，而COI基因数据库有GenBank数据库[27]和BOLD数据库[28]，考虑到许多科学家并不同时向BOLD和GenBank数据库提交COI序列信息[29]，综合两个数据库的比对结果更能保证COI基因鉴定结果的准确性。研究表明基于COI和16SrRNA基因的海参种内遗传距离均低于2%[26，30]，因此在进行序列比对时相似度≥98%的可判定为同一物种，低于95%的认定为不同种，而相似度介于95%～98%的需结合其他方法进一步验证。根据COI序列相似度结果，16种海参中除糙刺参（Stichopus horrens）外，其余15种的鉴定结果与形态学鉴定结果一致，物种序列相似度均≥99%，其中6种海参的结果结合了BOLD数据和GenBank数据库的鉴定结果。基于16S rRNA基因14种海参能够得到准确鉴定，标注为黄乳海参（Holothuria fuscogilva）和糙刺参（Stichopus horrens）的海参无法鉴定出明确物种（表2）。