《表2 代谢模型中的简称》

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《大肠杆菌产脂肪酶代谢通量分析》

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根据E.coli的生化反应网络和KEGG等数据库资源[13]，结合E.coli的生长代谢特性，建立了E.col代谢合成脂肪酶的反应网络（图1）及其代谢通量平衡模型，包括主要的碳骨架代谢途径和氨基酸生物合成途径。在建立网络模型时做了以下假设和简化处理:1) 细胞中的中间代谢物处于拟稳态，即瞬间浓度变化为0；2) 只考虑主要中心碳代谢反应的物流平衡[14]；3) 无分支点的几个连续反应简化为一个反应式，所有反应包括生物量合成都按照固定比例进行；4) 能量供需平衡，即合成菌体与产物所需的能量和EMP、HMP及TCA循环产生的能量总数相等。E.col中NADH和FADH2都可以通过电子传递链生成ATP[15]；5) 葡萄糖进入细胞均需消耗ATP；6) 脂肪酶Lip A的反应方程是根据其氨基酸组成确定的[16]，蛋白质合成所需要的能量为4.306μmol ATP/μmol氨基酸[17]，LipA的蛋白浓度通过SDS-PAGE电泳分析得到；7) 在代谢过程中，由于一部分碳源用于细胞的维持、产能、CO2释放以及分泌其它一些未知的代谢产物等，造成碳源的不平衡现象，该部分通量在代谢网络通量的计算时，并入生物量通量（VBiomass）中，生物量反应方程根据文献[18]建立。模型中包含的反应如表1，涉及到的简称如表2所示。