《表3 AP1蛋白适应性进化分析》

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《三白草AP1基因的表达和进化选择压力分析》

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通过不同的模型对AP1 2个同源基因编码蛋白AP1a和AP1b进行了分析。通过codeml程序的算法对AP1a和AP1b编码蛋白进行分析得到不同模型M 0、M 1、M 2、M 3、M 7、M 8的相关参数（表3）。与模型M 1、M 0、M 7相对应的M 2、M 3及M 8的假定条件均允许ω值大于1，即M 2、M 3及M 8的假定中均有正选择位点，通过相对应的2个模型进行LRT（likelihoodratiotest）[9]统计来确定模型是否显著。从表4可以看出，AP1蛋白的M 0模型预测的ω值远小于1，但是在LRT检验中M 3模型优于M 0模型，而M 2模型并不优于M 1模型，M 8模型也并不优于M 7模型。6个模型的结果均显示ω<1，说明AP1在进化过程中承受负选择，AP1基因松弛产生功能不同的拷贝。而在几个模型中并未检测到阳性选择位点。