《表2 茶树WRKY转录因子生物信息学分析》
通过对茶树基因组已注释的数据进行分析,分别获得8条WRKY包含完整ORF的cDNA序列。以“铁观音”芽叶cDNA为模板经PCR扩增及琼脂糖凝胶电泳检测,长度与预期相符(图1)。测序结果拼接后获得8条WRKY转录因子cDNA序列,对其核酸序列及氨基酸序列分别进行BLAsTn和BLAsTp同源性分析,根据与拟南芥WRKY家族的同源性分别命名为CsWRKY1、CsWRKY2、CsWRKY20、CsWRKY21、CsWRKY23、CsWRKY39、CsWRKY44和CsWRKY65,GenBank登录号分别为MG298951、MG298952、MG298955、MG298956、MG298957、MG298959、MG298960和MG298963。茶树中8条CsWRKYs转录因子的ORF长度为810~2 208 bp,编码氨基酸个数为269~735(表2),与拟南芥中WRKY同源基因的序列相似度为43%~58%,覆盖度为64%~100%。
图表编号 | XD0046897700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.02.12 |
作者 | 王鹏杰、陈笛、林浥、郑知临、郑玉成、杨江帆、岳川、叶乃兴 |
绘制单位 | 福建农林大学园艺学院茶学福建省高校重点实验室、福建农林大学园艺学院茶学福建省高校重点实验室、福建农林大学园艺学院茶学福建省高校重点实验室、福建农林大学园艺学院茶学福建省高校重点实验室、福建农林大学园艺学院茶学福建省高校重点实验室、福建农林大学园艺学院茶学福建省高校重点实验室、福建农林大学园艺学院茶学福建省高校重点实验室、福建农林大学园艺学院茶学福建省高校重点实验室 |
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