《表1 qRT-PCR引物》

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《基于转录组研究葡萄糖对葡萄试管苗碳代谢的影响》


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通过设定FDR(False discovery rate)<0.01和∣Log2(FC)∣≥2作为筛选差异基因的阈值。使用差异基因的Gene ID对葡萄数据库(http://www.genoscope.cns.fr/externe/GenomeBrowser/Vitis/)检索并获得相应的CDS区,通过在线引物设计软件Primer 3 Input(http://primer3.ut.ee/)进行引物(表1)设计。对RAN使用Primer ScriptTM RT regent Kit with gDNA Eeaser(TaKaRa)试剂盒进行反转录获得cDNA,并用SYBR Primer Ex TaqTMⅡ(TaKaRa)试剂盒进行定量分析。定量PCR仪为Light Cycler?96 Real-Time PCR System(Roche,瑞士)。内参基因为UBI(GenBank accession number:XM_002266714)。反应程序为95℃预变性30 s,95℃变性10 s,60℃退火30 s,72℃延伸30 s,40个循环,3次重复。反应结束后分析荧光值变化曲线及熔解曲线。基因的相对表达量采用2-ΔΔCT计算(Livak&Schmittgen,2001)。