《表3 被注释到的各种miRNA数》
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《基于高通量测序筛选‘紫娟’花青素合成相关的miRNA》
注:ZJ:紫鹃,YK:云抗10号,FD:福鼎大白茶。下同
3个文库中sRNA主要分布在21~24 nt范围内,其中24 nt的最多(图2),这些sRNA分布情况与其他报道的结果一致[22-23]。再利用bowtie将筛选后的sRNA定位到参考序列上,分析small RNA在参考序列上的分布情况。ZJ、YK和FD的clean reads中能mapped到参考序列的分别有5 774 584、6 835 843、6 278 768条。将mapped的sRNA通过NCBI数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)和Rfam数据库进行注释。被注释到的非编码RNAs,包括已知miRNA、新miRNA、rRNAs、tRNAs、snRNAs、snoRNAs、TAS基因等(表3)。
图表编号 | XD00438100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.12.15 |
作者 | 陈林波、夏丽飞、刘悦、蒋会兵、田易萍、陈亮 |
绘制单位 | 云南省农业科学院茶叶研究所、云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心、云南省茶学重点实验室、中国农业科学院茶叶研究所、云南省农业科学院茶叶研究所、云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心、云南省茶学重点实验室、云南省农业科学院茶叶研究所、云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心、云南省茶学重点实验室、云南省农业科学院茶叶研究所、云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心、云南省茶学重点实验室、云南省农业科学院茶叶研究所、云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心、云南省 |
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