《表4 朝谷58号和豫谷1号的胞嘧啶甲基化水平》

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《运用MSAP技术测定谷子基因组DNA胞嘧啶甲基化水平》


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Note:total methylated rate(%)=[(Ⅱ+Ⅲ)/(Ⅰ+Ⅱ+Ⅲ)]×100;fully methylated ratio(%)=[(Ⅲ)/(Ⅰ+Ⅱ+Ⅲ)]×100;hemi methylated ratio(%)=[(Ⅱ)/(Ⅰ+Ⅱ+Ⅲ)]×100;non methylated ratio(%)=[(Ⅰ)/(Ⅰ+Ⅱ+Ⅲ)]×100.

在计算全基因组CCGG位点上的胞嘧啶甲基化水平后(表4),发现朝谷58号的甲基化水平低于豫谷1号,这种甲基化水平的差异是由于两个品种胞嘧啶内侧全甲基化位点差异造成的。同时,两个品种的胞嘧啶内侧全甲基化水平均高于单链半甲基化水平,说明在谷子基因组中这种对称性的胞嘧啶内侧全甲基化位点是甲基化修饰的主要形式。此外,单链胞嘧啶半甲基化水平在两个品种中没有明显差异。仪治本等[21]在运用MSAP技术研究玉米杂交种及其亲本基因组DNA胞嘧啶甲基化水平中,其选用的第一组亲本Mo 17与Suwan 5的全甲基化水平分别为17.1%和24.4%,第二组亲本Suwan 1与太3221的全甲基化水平分别为24.6%和21.6%,与本实验的研究结果相同,说明同种作物的不同品种之间的全甲基化水平也不同。