《表3 差异甲基化位点甲基化水平与mRNA表达的相关性分析》

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《差异甲基化位点对肝细胞癌预后的相关性分析》


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不同差异位点的甲基化水平与其对应的基因mRNA表达的相关分析结果见表3。从表中可以看出,差异甲基化位点所在的16个基因(排除TCGA中没有基因表达的DAW1和TDGF1P2基因)中,差异甲基化位点甲基化水平与其对应基因的mRNA表达水平呈显著相关的m RNA有12个:cg06437004(LDHB),cg14541950(HIST3H2A),cg14399078(ADPRH),cg14541950(HIST3H2BB),cg20927059(TFCP2),cg21460081(HOXB4),cg08668790(ZNF154),cg21460081(HOXB3),cg08097882(POU4F1),cg24432073(CDKL2),cg08668790(ZNF551),cg13984181(EPHX4),cg14988503(CDKL2),其中只有cg08668790甲基化水平与ZNF551基因的mRNA表达水平呈正相关,其余的甲基化位点与基因m RNA表达水平呈显著的负相关。