《表6 解释的总方差:玉米大斑病病菌对热带玉米种质CML493的DNA甲基化变异与mRNA表达分析》
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《玉米大斑病病菌对热带玉米种质CML493的DNA甲基化变异与mRNA表达分析》
CML493接种大斑病病菌6、12 d,共有2 298个基因参与共表达(表6)。使用BLAST[14]软件,以HT1、HT2、HT3、HTN等关键词检索,与NR、Swiss-Prot、GO、COG、KOG、Pfam、KEGG、egg NOG[15~21]共8个数据库比对,以FPKM≥0为阈值,共筛选出5个基因ID,其中,1个基因是与HT1相关的基因Zm00001d003048,另1个与HT3相关的基因Zm00001d021324。根据基因表达量≥10进行筛选,Zm00001d003430、Zm00001d035925、Zm00001d-023984这3个基因表达量较高,可能参与抗大斑病功能等调控,有待进一步验证。5个基因中,4个基因呈现上调的趋势,1个基因呈下调的趋势。
图表编号 | XD00213186500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.15 |
作者 | 李春雷、苏桂华、张辰、孙伟峰、祁新、苏义臣 |
绘制单位 | 吉林省农业科学院玉米研究所、玉米国家工程实验室(长春)、吉林农业大学农学院、吉林省农业科学院玉米研究所、玉米国家工程实验室(长春)、吉林农业大学农学院、吉林农业大学农学院、吉林农业大学农学院、吉林省农业科学院玉米研究所、玉米国家工程实验室(长春) |
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