《表3 不同时期烟田微生物Alpha多样性》

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《不同连作年限对烟草根际土壤微生物区系的影响》


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Alpha多样性也被称为生境内物种多样性,主要关注均匀生境下的物种数目[15]。不同连作年限烟根际土壤微生物Alpha多样性的分析结果见表3,其中OTU表示将所有样本序列按照序列间的距离进行聚类,然后将相似度高于97%的序列定义为一个操作分类单元,故OTU数可表示烟草根际土壤中物种数量的多少,为实测值;Shannon指数代表烟草根际土壤中微生物的均匀度,即多样性;Chao1指数则代表根际微生物的丰富度,数量的多少,是计算获得;Coverage指数表明各样品文库的覆盖率,其数值越高,样本中序列没有被检测出的概率越低,该指数反映了本次测序结果是否代表样本的真实情况,一般Coverage指数高于0.95,即代表该检测可反映样本的真实情况[16]。