《表3 烟田土壤中微生物的Alpha多样性》

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《烟株生长过程中土壤微生物的变化特征》

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环境中微生物的多样性（Alpha）分析可以反映微生物群落的丰度和多样性变化（表3）。Coverage指数是指各样本文库的覆盖率，其数值越高，则样本中序列被测出的概率越高，而没有被测出的概率越低。本实验中各样本细菌的Coverage值都在94%以上，真菌的Coverage值都在99%以上，表明本次测序结果能够代表样本中微生物的真实情况。Sobs（the observed richness）值表示丰富度实际观测值，既OTU数目。本实验中细菌Sobs指数在各生长时期差异不大，非健康烟田土壤中Sobs有先增长后减少的趋势；真菌Sobs指数在旺长期最少。Chao指数反映群落丰富度（Community richness），指数越大群落丰富度越高；Shannon指数能反映群落多样性（Community diversity），Shannon指数值越大，说明群落多样性越高。非健康烟田土壤中细菌的Chao、Shannon指数均值在烟株团棵期时达到最高，随后逐渐降低，表明细菌群落在烟株团棵期时最为丰富、多样性最高，而健康土壤中细菌的多样性指数没有明显规律；真菌的Chao、Shannon指数均在烟株的旺长期时最低，与稀释平板法中真菌的数量相吻合，表明真菌群落在烟株旺长期时丰富度降低、多样性减少。健康和非健康烟田之间土壤微生物的Alpha多样性没有显著性差异。