《表1 PCR引物序列:IRPA对β-内酰胺酶类抗菌药物主要耐药机制研究》

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《IRPA对β-内酰胺酶类抗菌药物主要耐药机制研究》


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采用细菌基因组DNA快速抽提试剂盒提取细菌DNA作为PCR模板,提取完成后置-20℃备用。PCR分别扩增铜绿假单胞菌5种金属β-内酰胺酶(MBLs)基因———IMP、VIM、SIM、GIM、SPM,6种超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)基因———TEM、VEB、SHV、PER、OXA-2、OXA-10,引物序列、相关参数及参考文献见表1。PCR扩增体系采用50μL体系:TE buffer 5μL,dNTP 4μL,上、下游引物各1μL,Taq酶0.25μL,DNA模板2μL,ddH2O 36.75μL。PCR扩增条件如下:金属酶,94℃预变性5min,然后94℃30s→退火30s→72℃60s,循环40个周期,最后72℃延伸7min,具体退火温度见表1。ESBLs:扩增产物>500bp,93℃预变性2min,94℃60s→55℃退火60s→72℃延伸60s,共35个循环,最后72℃延伸5min;PCR产物<500bp,93℃预变性5min,93℃30s→55℃退火30s→72℃延伸30s,共35个循环,最后72℃延伸5min。PCR扩增产物加入10μL 6×DNA loading buffer,经1%琼脂糖凝胶,120mV电泳30~40min,紫外灯下观察结果,出现与目的条带大小一致即认为阳性,拍照保存,切胶回收。