《表1 四种改良CTAB法提取的甘蔗基因组DNA的质量比较》

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《用于克隆及分子标记分析的甘蔗高质量基因组DNA提取方法》

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四种改良CTAB法提取出来的甘蔗基因组DNA的浓度和纯度通过Quawell Q3000紫外分光光度计检测。方法一在沉淀DNA前使用了一次氯仿抽提，所得DNA的最终浓度为270 ng/μL，所得DNA的A260/A280和A260/A230分别为1.733和1.946，这两个比值分别未超过1.8和2.0，表明方法一提取得到的甘蔗基因组DNA存在较轻的蛋白质和多糖污染。方法二在沉淀DNA前使用了两次氯仿抽提，所得DNA的最终浓度为210 ng/μL，所得DNA的A260/A280和A260/A230分别为1.733和2.024。其中，A260/A280的比值未超过1.8，而A260/A230的比值刚刚超过了2.0，表明方法二提取得到的甘蔗基因组DNA存在较轻的蛋白质污染但无多糖污染。方法三在沉淀DNA前使用了一次氯仿和一次平衡酚抽提，所得DNA的最终浓度为288 ng/μL，所得DNA的A260/A280和A260/A230分别为1.803和2.237，这两个比值分别超过1.8和2.0，表明方法三提取得到的甘蔗基因组DNA不存在蛋白质和多糖污染，但该方法有利用到强腐蚀性的平衡酚，不安全环保，故不建议；方法四在沉淀DNA前使用了一次平衡酚抽提，所得DNA的最终浓度为241 ng/μL，所得DNA的A260/A280和A260/A230分别为1.812和2.142，这两个比值分别超过1.8和2.0，表明方法三提取得到的甘蔗基因组DNA不存在蛋白质和多糖污染，但有利用到强腐蚀性的平衡酚，不安全环保，故也不建议（表1）。