《表2 橡胶树Ago蛋白基因信息》

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《橡胶树Ago蛋白基因家族分析》


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注:Locus:基因在基因组或scaffolds上的定位;Location:表达的蛋白定位;Chlo:叶绿体;Nucl:细胞核;Cyto:细胞质;Mito:线粒体Note:Locus:Gene location in the genome or scaffolds;Location:Gene expression in cells;Chlo:Chloroplast;Nucl:Nucleus;Cyto:Cytoplasm;Mito:Mitochon

通过基因注释及ProtParam软件进一步进行蛋白质特性分析,这18个Ago蛋白基因最小为2170 bp,最长的为8 411 bp,平均长度5 594 bp;Ago蛋白长度最短的为577 aa,最长的为1 237 aa,平均长度950 aa;各Ago蛋白质等电点最小为8.66,最大的为9.47,平均等电点为9.22;Ago蛋白质的分子量最小的为65.26 kD,最大的为138.29 kD,平均分子量为106.64 kD;各Ago蛋白质预测的定位位点包括叶绿体(1个)、细胞核(13个)、细胞质(3个)、线粒体(1个)(表2) 。这些Ago蛋白的序列长度、分子量大小及等电点等理化性质来看,橡胶树的Ago蛋白的理化性质与其他物种已知的Ago蛋白相似(Mirzaei et al.,2014);这些Ago蛋白定位于不同的细胞器,说明它们在细胞内不同的部位发挥作用,如拟南芥AtAgo1、AtAgo2、AtAgo4、At Ago5也定位于细胞核和细胞质(Fang and Spector,2007;Li et al.,2008;Takeda et al.,2008)。