《表2 AOB、AOA、Comammox Clade A、Comammox Clade B amo A基因的引物序列Table 2 Primers for AOB, AOA, Comammox Cla
首先,采用Fast DNA?SPIN Kit for Soil(MP Biomedicals,LLC)试剂盒、并按试剂盒操作说明提取土壤微生物总DNA,并于-20℃保存待测.随后,采用实时荧光定量PCR法在Quant StudioTM6Flex定量PCR仪(Thermo Fisher Scientific,Singapore)上测定氨氧化细菌(AOB)、氨氧化古菌(AOA)及全程氨氧化菌Comammox Clade A和Clade B amo A基因的拷贝数.AOB、AOA、Comammox Clade A、Comammox Clade B的amo A基因定量PCR所用扩增引物见表2.AOB、AOA、Comammox Clade A、Comammox Clade B的amo A基因定量PCR所用反应体系均为20μL,主要包含:待扩增的模板DNA 1μL、上下引物及ROX染料各0.4μL,Taq DNA聚合酶10μL、灭菌水7.8μL.AOA amo A基因定量PCR扩增条件为:95℃,1.5min;40×(95℃,30 s;55℃,45 s;72℃,45 s with plate read);Melt curve 60.0℃to 95.0℃,increment0.5℃,0:05+plate read.AOB扩增条件为:95℃,3.0 min;38×(95℃,30 s;60℃,1.5 min with plate read);Melt curve 60.0℃to 95.0℃,increment0.5℃,0:05+plate read.Comammox Clade A、Comammox Clade B的amo A基因定量PCR扩增条件均为:95℃,3.0 min;45×(95℃,30 s;52℃,45s;72℃,1 min with plate read);Melt curve 60.0℃to 95.0℃,increment 0.5℃,0:05+plate read.
图表编号 | XD0025392100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.10.15 |
作者 | 王梅、王智慧、石孝均、蒋先军 |
绘制单位 | 西南大学资源环境学院、西南大学资源环境学院、西南大学资源环境学院、西南大学资源环境学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |