《表1 与间充质干细胞成骨分化相关的长链非编码RNA》
注:h AMSC为人羊膜来源间充质干细胞;h PDLSC为人牙周膜干细胞;m BMSC为小鼠骨髓间充质干细胞;r MSC为大鼠间充质干细胞;i MSC为永生化间充质干细胞;Mouse calvarial preosteoclast cells为小鼠颅骨前成骨细胞;C3H10T1/2 cells为小鼠胚胎间充质干细胞株
如前所述,由MSC向成骨谱系定向分化是一多时期、多阶段的动态过程。不同来源的MSC,成骨分化不同的时期与阶段间,基因的表达情况可能完全不同,作用的方式也可能存在差异。随着基因测序技术的不断发展,利用高通量测序配合生物信息学分析已成为大规模筛选与成骨分化相关lnc RNA的重要手段。例如,Zhang等[19]利用高通量测序手段对正常及成骨诱导分化后的人骨髓间充质干细胞(human bone marrow-derived mesenchymal stem cell,h BMSC)进行基因测序,配合生物信息学手段对比两者之间表达存在明显差异基因,发现h BMSC成骨向分化后,有785个lnc RNA表达显著升高,有623个显著下降。接下来其又进一步筛选出6个可能的关键lnc RNA,并通过细胞学实验验证了其中的lnc RNA XR_111050对h BMSC成骨分化的影响。又如,Yu等[20]通过类似方式筛选人脂肪间充质干细胞(human adipose tissue-derived mesenchymal stem cell,h ASC)成骨诱导分化过程中差异性表达的lnc RNA,最终明确了在h ASC成骨分化中特异性高表达的lnc RNA PCAT1,并进一步探究其可能的调控机制。本文试总结了近年来不同研究中与成骨分化相关的lnc RNA表达谱,具体内容可参见表1。
图表编号 | XD00229145800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.01 |
作者 | 李润泽、任剑寒、黄德兰、罗皓天、周晨、王伟财 |
绘制单位 | 中山大学附属口腔医院光华口腔医学院广东省口腔医学重点实验室、中山大学附属口腔医院光华口腔医学院广东省口腔医学重点实验室、中山大学附属口腔医院光华口腔医学院广东省口腔医学重点实验室、中山大学附属口腔医院光华口腔医学院广东省口腔医学重点实验室、中山大学附属口腔医院光华口腔医学院广东省口腔医学重点实验室、中山大学附属口腔医院光华口腔医学院广东省口腔医学重点实验室 |
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