《表3 20株猪源性沙门氏菌直系基因与旁系基因分析》

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《生鲜畜禽肉中沙门氏菌全基因组分析与分子溯源》

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直系同源是指不同物种之间的某一部分序列具有同源性，例如蛋白质的同源性，DNA序列的同源性，而单拷贝直系同源基因是指在不同物种中具有相同序列，相同功能，但基因组中拷贝数为1的基因。单拷贝直系同源基因，大部分为管家基因，在分子系统学中起重要的分子标记作用，通常用于构建生命树的主干及主干和末梢之间的分枝[8]。分别对20株鸡源性沙门氏菌与20株猪源性沙门氏菌的基因组信息进行分析，统计基因家族、单拷贝直系同源基因、多拷贝直系同源基因、独立旁系同源基因、其他直系同源基因。由表3、4可知，20株猪源性沙门氏菌共有3 988个基因家族，单拷贝直系同源基因数在2 170～2 191，鸡源性沙门氏菌共有3 919个基因家族，单拷贝直系同源基因数在2 159～2 183。单拷贝直系同源基因主要包括内肽酶活性基因、水解酶基因、蛋白质分泌调节基因、核糖体结构基因、谷氨酰-tRNA还原酶基因等。