《表2 20株鸡源性沙门氏菌基因组信息》

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《生鲜畜禽肉中沙门氏菌全基因组分析与分子溯源》

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采用二代测序技术对40株沙门氏菌进行全基因组测序，并进行序列组装。由表1可知，猪源性沙门氏菌的scaffold数目在24～71，基因组总长度分布为3 842 688～5 019 323bp，GC含量平均为54.08%。由表2可知，基因数在4 012～4 382，基因平均长度在932～958bp。鸡源性沙门氏菌的scaffold数目在23～73，基因组总长度分布为4 638 420～5 201 462bp，GC含量平均为51.93%。基因数在4 016～4 476，基因平均长度在930～959bp。20株猪源性沙门氏菌基因组总长度的平均值比20株鸡源性沙门氏菌基因组总长度的平均值小425 799bp，而GC平均含量却比20株鸡源性沙门氏菌多2.15%，说明猪源性沙门氏菌与鸡源性沙门氏菌在基因组层面存在差异，也暗示两者来源不同，在运输与销售环节的交叉污染可能性小，而饲养、屠宰运输环节猪与猪之间、鸡与鸡之间污染可能性大。