《表2 转录组数据组及比对统计》
Q20:Phred数值大于20的碱基占总体碱基的百分比;Q30:Phred数值大于30的碱基占总体碱基的百分比(Phred:在碱基识别过程中通过一种概率模型计算得到,可准确预测碱基判别的错误率);OWBB1,OWBB2,OWBB3,OWBB4分别为杂交F1代鸭黑色羽毛囊组织的4个生物学重复,OWBW1,OWBW2,OWBW3,OWB
本研究共构建连城白鸭与樱桃谷鸭杂交F1代鸭8个黑白羽毛囊组织的转录组文库,再利用Novaseq PE150平台进行转录组测序获得原始数据,将测序数据去除接头及低质量数据后共获得449067 116个高质量数据,总碱基数目为67.36 Gb,每个样品均获得了7.4 Gb以上的碱基,8个样品平均GC含量为52%,Q20均在96.73%以上,Q30均在91.78%以上(表2)。表明测序数据质量较好,符合实验要求,可用于后续结果分析。
图表编号 | XD00224409600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.09.25 |
作者 | 蒋兵兵、黄曼曼、白天、曾涛、陈黎、沈军达、陶争荣、周玮、刘国发、卢立志、李海英 |
绘制单位 | 新疆农业大学动物科学学院、浙江省农业科学院畜牧兽医研究所、新疆农业大学动物科学学院、浙江省农业科学院畜牧兽医研究所、浙江省农业科学院畜牧兽医研究所、浙江省农业科学院畜牧兽医研究所、浙江省农业科学院畜牧兽医研究所、浙江省农业科学院畜牧兽医研究所、浙江省农业科学院畜牧兽医研究所、江苏桂柳牧业集团有限公司、江苏桂柳牧业集团有限公司、浙江省农业科学院畜牧兽医研究所、新疆农业大学动物科学学院 |
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