《表2 10个小麦叶锈菌候选效应蛋白组成分析》

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《小麦叶锈菌10个候选效应蛋白特点及其qRT-PCR分析》

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对这10个候选效应蛋白进行分析发现所有测试基因均含有丰富的半胱氨酸残基。对氨基酸大小统计分析发现7个候选效应蛋白小于300个氨基酸，Pt65276、Pt16696和Pt70001的氨基酸个数超过300个。利用NCBI进行Blast比对发现10个候选效应蛋白均为假定蛋白并且与小麦叶锈菌BBBD和小麦秆锈菌具有同源性。利用Perl软件对其进行已知的基序搜索，发现Pt87611、Pt87613、Pt65276含有白粉菌[Y/F/W]x C结构域；Pt89171含有稻瘟菌[L/I]x AR结构域，其余基因不含有已知结构域（表2）。对3个含有[Y/F/W]x C结构域的基因进行序列比对发现三者之间并无相似性（图2）。Pfam搜索family和domain发现Pt16696和Pt70001都属于Glycosyl hydrolase family，但序列比对发现二者同源性仅为29%；而Pt65276含有Dioxygenase domain （表3）。