《表3 14 338对碱基分布及变异比较》

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《基于SNP标记的爆裂玉米农家品种遗传多样性》

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用56K高密度玉米基因芯片对53份供试材料进行DNA扫描，有51份Call rate值均大于0.9，质检合格率94.6%，获得多态性标记33 888个，占标记总数的65.6%；对样品进行SNP位点质控，获得可用标记14 338个。这些标记在爆裂玉米的10条染色体上均有分布，平均每条染色体上分布1 434个。其中1号染色体上最多，为2 302个，碱基对比例占16.06%；10号染色体最少，为848个，碱基对比例为5.91%。染色体上SNP标记的数量与染色体的物理长度相关。14 338个SNP标记包括6种类型的碱基替换，其中A/G类型有5 805个，碱基对比例为40.49%，在所有碱基替换类型中最多。A/T类型的最少，为149个，碱基对比例仅为1.04%（表3）。