《表5 以X1为代表的4个分离株NADH1基因的变异位点及碱基序列变化情况》

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《线粒体NADH1基因和微卫星标记在棘球绦虫感染检测中的应用》

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将所有阳性样品NADH1序列通过Clustal X 1.83进行比对，去除两端不准确序列后获得的序列长度为508 bp，以C1为代表的4个分离株（样品号：C1、C19、A18、S2）基因序列与GenBank中细粒棘球绦虫NADH1基因序列（EF367301.1）同源性为100%；以X1为代表的4个分离株（样品号：X1、H7、Y13、T）基因序列与GenBank中细粒棘球绦虫NADH1基因序列（JX217864.1）同源性为99%；以Em1为代表的2个分离株（样品号：Em1和Em2）基因序列与GenBank中多房棘球绦虫NADH1基因序列（AB668376.1）同源性为98%；以Em5为代表的2个分离株（样品号：Em5和Em5-1）基因序列与AB668376.1同源性为99%；1#和2#分离株基因序列均与GenBank中多房棘球绦虫NADH1基因序列（KY094609.1）同源性为99%，不同株基因的变异位点及碱基序列变化见表5、表6、表7。基于棘球绦虫NADH1引物扩增的基因片段并利用NJ法构建了遗传进化树（图3），进化树分为3大枝，不同地区牛/羊感染包虫病阳性样品与细粒棘球绦虫（EF367301.1和JX217864.1）参考序列归于一支，不同地区老鼠和狐狸感染包虫病阳性样品与多房棘球绦虫（AB668376.1和KY094609.1）参考序列归于一支，细粒棘球绦虫G5、G6和G7基因型参考序列归于一枝，从建立的进化树中可以看出不同地区牛/羊感染包虫病病原与细粒棘球绦虫亲缘关系较近，基因型属于G1型，老鼠和狐狸感染包虫病病原与多房棘球绦虫亲缘关系较近。