《表2 mtDNA D-loop区的变异位点及碱基数统计》

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《实验用SPF大白猪和长白猪母系遗传结构分析》

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分析107个个体的mtDNA D-loop区序列，获得mtDNA D-loop区核苷酸序列约1 500 bp，每条序列包含1段10个碱基（TGCGTACATGCG）的重复片段。去除重复片段，全长1 149 bp。不考虑插入和缺失的情况共检测到40个核苷酸多态位点（number of nucleotide variable sites，NV），占核苷酸序列总数的3.5%，其中10个为单一多态位点（nucleotide singleton variable sites，NS），30个为简约信息位点（nucleotide parsimony information sites，NPi）。碱基成分分析发现，A、T、C、G 4种核苷酸所占比例平均为35.6%、25.54%、25.9%和12.96%，G+C平均含量为38.86%，A+T的含量61.14%明显高于G+C的含量（表2）。大白猪和长白猪的碱基变异数分布基本一致，主要集中在100~400 bp之间，与巴马小型猪和融水小型猪相差较大；核苷酸多样度变化趋势与碱基变异数分布趋势整体基本一致，整个区域都存在不同程度的核苷酸变异，核苷酸多样度最高峰值出现在第200 bp左右（图2）。