《表2 Md CAT成员的鉴定列表》

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《苹果阳离子氨基酸转运蛋白(CAT)的鉴定、比较与表达分析》


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表中,链表示基因在参考基因组的位置,“+”代表测序正链,“-”代表测序负链;WoLF PSORT的亚细胞位置取预测结果中最高概率者代表。

利用AtCAT作查询序列,在‘金冠’苹果GDD-H13参考基因组中,共筛选并确定15个MdCAT成员(结构域已过滤)。与拟南芥类似,这些成员具有2个(AA_permease/AA_permease_2和AA_permease_C)典型的保守域。通过对它们的基础特征信息进行统计(表2),我们发现15个成员的基因组分布并不均衡。其中Chr02、Chr04、Chr06、C h r 0 7和C h r 1 4染色体上各有1个M d C AT基因,Chr10和Chr12染色体上各存在2个MdCAT基因,而苹果5号染色体具有最多的CAT基因数目(6个),分别为:Md CAT3、Md CAT4、Md CAT5、MdCAT6、MdCAT7和MdCAT8。MdCAT的编码序列长度在1 359 bp (MdCAT5)到1 950 bp (MdCAT14)之间。由此,氨基酸数目最多的成员为MdCAT14(649 aa),最少的为MdCAT5 (452 aa)。定位分析发现,所有MdCAT大概率位于细胞膜上,而且两种工具在亚细胞位置的预测上具有同一性,说明结果可信度较高。