《表2 Md CAT成员的鉴定列表》
提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《苹果阳离子氨基酸转运蛋白(CAT)的鉴定、比较与表达分析》
表中,链表示基因在参考基因组的位置,“+”代表测序正链,“-”代表测序负链;WoLF PSORT的亚细胞位置取预测结果中最高概率者代表。
利用AtCAT作查询序列,在‘金冠’苹果GDD-H13参考基因组中,共筛选并确定15个MdCAT成员(结构域已过滤)。与拟南芥类似,这些成员具有2个(AA_permease/AA_permease_2和AA_permease_C)典型的保守域。通过对它们的基础特征信息进行统计(表2),我们发现15个成员的基因组分布并不均衡。其中Chr02、Chr04、Chr06、C h r 0 7和C h r 1 4染色体上各有1个M d C AT基因,Chr10和Chr12染色体上各存在2个MdCAT基因,而苹果5号染色体具有最多的CAT基因数目(6个),分别为:Md CAT3、Md CAT4、Md CAT5、MdCAT6、MdCAT7和MdCAT8。MdCAT的编码序列长度在1 359 bp (MdCAT5)到1 950 bp (MdCAT14)之间。由此,氨基酸数目最多的成员为MdCAT14(649 aa),最少的为MdCAT5 (452 aa)。定位分析发现,所有MdCAT大概率位于细胞膜上,而且两种工具在亚细胞位置的预测上具有同一性,说明结果可信度较高。
图表编号 | XD00217986800 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2020.12.20 |
作者 | 王寻、韩月彭、由春香、王小非、郝玉金 |
绘制单位 | 山东农业大学园艺科学与工程学院作物生物学国家重点实验室山东果蔬优质高效生产协同创新中心、中国科学院武汉植物园中国科学院植物种质创新与特色农业重点实验室、山东农业大学园艺科学与工程学院作物生物学国家重点实验室山东果蔬优质高效生产协同创新中心、山东农业大学园艺科学与工程学院作物生物学国家重点实验室山东果蔬优质高效生产协同创新中心、山东农业大学园艺科学与工程学院作物生物学国家重点实验室山东果蔬优质高效生产协同创新中心 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |