《表4 O-Ch1分离物的重组分析》

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《甘薯羽状斑驳病毒O株系和RC株系中国分离物全基因组序列分析及其遗传特征》

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为了明确我国的O-Ch1、RC-Ch1分离物是否存在潜在的重组事件，利用RDP5软件中的7种算法（P≤0.05为显著），将O-Ch1、RC-Ch1与GenBank登录的其他48个分离物基因组全序列进行重组分析。结果表明（表4），在O-Ch1分离物中检测到3个潜在的重组事件（其他分离物重组事件未列出）。重组事件1发生在7 731—9 710 nt，获得7种算法支持，最低P值为1.095×10-44(3Seq），最高P值为8.317×10-17(GENECONV），主要亲本为日本的O株系Ordinary分离物，次要亲本为东帝汶的O株系TM33C分离物。重组事件2发生在135—10 012 nt，获得4种算法支持，最低P值为1.561×10-56(3Seq），最高P值为7.437×10-3(Chimaera），主要亲本为秘鲁的EA株系Piu3分离物，次要亲本为澳大利亚的O株系Aus5-3B分离物。重组事件3发生在4 825—6 948 nt，获得3种算法支持，最低P值为1.104×10-3(Max Chi），最高P值为1.256×10-2(3Seq），主要亲本为澳大利亚的O株系Aus13B分离物，次要亲本为秘鲁的EA株系Piu3分离物。RC-Ch1分离物未检测到重组事件发生。