《表2 目标区间内的候选基因》
根据关联分析结果,位于12号染色体上的SNP位点AX-117626364最可能与开花期性状紧密关联。因此,以Q_FT1上下500 kb区间范围内进行候选基因筛选。如表2所示,目标区间内总共有19个编码基因,注释功能为细胞色素P450、突触结合、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性、羧酸酯酶活性、MADS-box蛋白、溶血磷脂酰基转移酶、木质部丝氨酸蛋白酶、类枯草菌素蛋白酶、磷脂酶β1、过氧化物酶体生物发生蛋白等。其中Ntab0279640和Ntab0279620编码与拟南芥MADS-box转录因子功能相似蛋白,控制着花器官形成、发育等重要生理过程[19];Ntab0279630、Ntab0279610和Ntab0279600与拟南芥(Arabidopsis thaliana)中的花卉整合子SOC1功能相似,调控上游CONSTANS基因(CO)影响开花时间[20]。其中Ntab0279610距离最显著的SNP位点的物理距离仅为32.11 kb,因此初步将其确定为控制烤烟开花期关键候选基因。
图表编号 | XD00216387400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.01 |
作者 | 孙滢、姜自鹏、刘洪泰、孙明铭、蒋彩虹、任民、刘旦、罗朝鹏、张剑锋、杨军、杨爱国、程立锐 |
绘制单位 | 中国农业科学院烟草研究所、中国农业科学院烟草研究所、中国农业科学院烟草研究所、中国农业科学院烟草研究所、中国农业科学院烟草研究所、中国农业科学院烟草研究所、中国农业科学院烟草研究所、中国烟草总公司郑州烟草研究院、中国烟草总公司郑州烟草研究院、中国烟草总公司郑州烟草研究院、中国农业科学院烟草研究所、中国农业科学院烟草研究所 |
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