《表2 目标区间内的候选基因》

《表2 目标区间内的候选基因》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《烟草开花期全基因组关联分析》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录

根据关联分析结果,位于12号染色体上的SNP位点AX-117626364最可能与开花期性状紧密关联。因此,以Q_FT1上下500 kb区间范围内进行候选基因筛选。如表2所示,目标区间内总共有19个编码基因,注释功能为细胞色素P450、突触结合、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性、羧酸酯酶活性、MADS-box蛋白、溶血磷脂酰基转移酶、木质部丝氨酸蛋白酶、类枯草菌素蛋白酶、磷脂酶β1、过氧化物酶体生物发生蛋白等。其中Ntab0279640和Ntab0279620编码与拟南芥MADS-box转录因子功能相似蛋白,控制着花器官形成、发育等重要生理过程[19];Ntab0279630、Ntab0279610和Ntab0279600与拟南芥(Arabidopsis thaliana)中的花卉整合子SOC1功能相似,调控上游CONSTANS基因(CO)影响开花时间[20]。其中Ntab0279610距离最显著的SNP位点的物理距离仅为32.11 kb,因此初步将其确定为控制烤烟开花期关键候选基因。